中文Новы варыянт каранавіруса, штам 501Y-V2 з Паўднёвай Афрыкі
18 снежня 2020 года ў ПАР быў выяўлены мутант 501Y-V2 новага каранавіруса.Зараз паўднёваафрыканскі мутант распаўсюдзіўся больш чым у 20 краінах.Эксперыменты паказалі, што вышэйзгаданыя мутанты новага каранавіруса могуць несці іншыя варыянты новага каранавіруса мутацый K417N/T, E484K і N501Y, якія могуць паменшыць нейтралізуючую здольнасць індукаваных вакцынай плазменных нейтралізуючых антыцелаў.Аднак у параўнанні з эталонным геномам Wuh01 (парадкавы нумар MN908947), паслядоўнасць 501Y.V2 паўднёваафрыканскага мутантнага геному мае 23 варыянты нуклеатыдаў.Ён мае тую ж самую мутацыю N501Y, што і брытанскі мутант падтыпу B.1.1.7, але ўсё яшчэ змяшчае мутацыі ў двух ключавых сайтах E484K і K417N бялку S, якія аказваюць патэнцыйна важны ўплыў на здольнасць віруса заражаць.
Новы каранавірус - гэта адналанцуговы РНК-вірус, мутацыі геному якога сустракаюцца часцей.Выяўленне адной мэты можа лёгка прывесці да прапушчанага выяўлення ўзораў з нізкай віруснай нагрузкай і мутаванымі штамамі віруса.Хуткасць паўторнага абследавання пры аднаразовым станоўчым выяўленні мэты можа дасягаць больш за 10%, што можа павялічыць нагрузку і падоўжыць час дыягностыкі.Выяўленне некалькіх мэтаў і ўзаемная праверка вынікаў кожнай мэты могуць павялічыць хуткасць выяўлення і палегчыць раннюю дыягностыку.
Малюнак 1. Прынцыповая схема механізму заражэння новым каранавірусам
Новы каранавірусны мутант B.1.1.7 з Брытаніі
26 снежня 2020 г. першая навуковая праца пра штам B.1.1.7 была апублікавана ў Інтэрнэце.Інстытут гігіены Лонданскага ўніверсітэта Вялікабрытаніі і трапічных хвароб пацвердзіў, што штам B.1.1.7 больш здольны да распаўсюджвання, чым іншыя штамы, што складае больш за 56% (95% ДІ 50-74%).Паколькі гэты новы мутантны штам мае больш відавочную здольнасць перадачы, кантраляваць COVID-19 стала цяжэй.На наступны дзень Бірмінгемскі ўніверсітэт у Вялікабрытаніі загрузіў артыкул на MedRxiv.Даследаванне паказала, што колькасць копій гена віруса ORF1ab і N у пацыентаў, інфіцыраваных мутантным штамам B.1.1.7 (выпадзенне S-гена), значна павялічылася;гэта з'ява назіралася ў насельніцтва.У гэтым артыкуле адзначаецца, што пацыенты, інфіцыраваныя брытанскім мутантам B.1.1.7, маюць значна большую вірусную нагрузку, таму гэты мутант таксама можа быць больш патагенным.
Малюнак 2. Паслядоўнасць мутацыі геному, якая змяшчаецца ў мутантным штаме каранавіруса B.1.1.7 з Брытаніі
Малюнак 3. Мутацыя N501Y адбылася як у Брытаніі, так і ў Паўднёвай АфрыцыВарыянты
Набор для выяўлення новых варыянтаў каранавіруса
Кампанія Chuangkun Biotech Inc. паспяхова распрацавала набор для выяўлення новых варыянтаў каранавіруса B.1.1.7 і 501Y-V2.
Перавагі гэтага прадукта: высокая адчувальнасць, адначасовае выяўленне 4 мішэняў, якія ахопліваюць асноўныя месцы мутацыі мутантнага штаму B.1.1.7 і паўднёваафрыканскага мутантнага штаму 501Y.V2.Гэты набор можа адначасова выяўляць сайты мутацыі N501Y, HV69-70del, E484K і новы ген каранавіруса S;Хуткі тэст: ад збору ўзору да выніку патрабуецца ўсяго 1 гадзіна 30 хвілін.
Малюнак 4. Крывая ампліфікацыі брытанскага варыянту выяўлення COVID-19
Малюнак 5. Крывая ампліфікацыі паўднёваафрыканскага варыянту COVID-19
Малюнак 6. Крывая ампліфікацыі новага каранавіруса дзікага тыпу
Незразумела, як гэтыя мутацыі акумулююць новыя доўгатэрміновыя наступствы пандэміі COVID-19.Але гэта нагадвае нам, што гэтыя мутацыі могуць паўплываць на эфектыўнасць натуральнага імунітэту і імунітэту, атрыманага ў выніку вакцынацыі.Гэта таксама нагадвае нам, што нам трэба пастаянна сачыць за новым каранавірусам на працягу доўгага часу і абнаўляць вакцыну супраць COVID-19, каб справіцца з эвалюцыяй новага каранавіруса.
Час публікацыі: 12 сакавіка 2021 г